Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC169A6NNP5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC169A6NNP5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms