Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP73A6NFT4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CFAP73A6NFT4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms