Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
SSPOA2VEC9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms