Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNSTRNQ9Y448 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms