Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms