Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ERVW-1Q9UQF0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms