Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRAK1Q9UPV9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms