Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLC12A4Q9UP95 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms