Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GTF2A1LQ9UNN4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2A1LQ9UNN4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms