Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNRF3Q9ULT6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms