Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MBD1Q9UIS9 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MBD1Q9UIS9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms