Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NPC1L1Q9UHC9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NPC1L1Q9UHC9 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms