Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
FAM8A1Q9UBU6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM8A1Q9UBU6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms