Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SPASTQ9UBP0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SPASTQ9UBP0 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms