Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL42Q9P2K6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL42Q9P2K6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms