Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CLN6Q9NWW5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms