Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SNX15Q9NRS6 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms