Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEMA4BQ9NPR2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms