Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FANCFQ9NPI8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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