Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AMBRA1Q9C0C7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms