Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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FOXQ1Q9C009 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
FOXQ1Q9C009 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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