Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
KRTAP4-3Q9BYR4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms