Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
VN1R3Q9BXE9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VN1R3Q9BXE9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms