Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SSBP4Q9BWG4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SSBP4Q9BWG4 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
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