Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KATNB1Q9BVA0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms