Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EFHD1Q9BUP0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EFHD1Q9BUP0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms