Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
POLR3CQ9BUI4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
POLR3CQ9BUI4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms