Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SGIP1Q9BQI5 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms