Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NPAS2Q99743 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms