Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHP1Q99653 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHP1Q99653 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms