Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPS6KC1Q96S38 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms