Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SAMD8Q96LT4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SAMD8Q96LT4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms