Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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GTF3C6Q969F1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF3C6Q969F1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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