Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BHMTQ93088 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BHMTQ93088 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms