Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB13Q92826 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms