Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HERVK_113Q902F9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms