Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
LINC00612Q8N6U2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms