Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNE4Q8N205 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNE4Q8N205 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms