Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPAP2Q8IXW5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms