Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC103Q8IW40 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC103Q8IW40 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms