Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC71Q8IV32 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC71Q8IV32 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms