Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G1

CLNK, Cytokine-dependent hematopoietic cell linker, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNKQ7Z7G1 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLNKQ7Z7G1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms