Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XIRP1Q702N8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XIRP1Q702N8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms