Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GDF6Q6KF10 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDF6Q6KF10 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms