Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SLX4IPQ5VYV7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLX4IPQ5VYV7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms