Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RIF1Q5UIP0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms