Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC27A3Q5K4L6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms