Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TDRD12Q587J7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms