Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDCA8Q53HL2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDCA8Q53HL2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms