Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TTLL9Q3SXZ7 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms